Die Risiken entsprechen bei der Durchführung des Proteomis-Profils den Risiken einer einfachen Blutabnahme aus der Armvene.
Prinzipielle Nebenwirkungen bei der Anwendung der Naturheilmittel können nicht genannt werden, sondern sind im Einzelfall von der Substanz, der Anwendungsart oder der Dosierung abhängig. Aus 40 Jahren der Anwendung dieser Methode sind keine Zwischenfälle bekannt, die Medikamente sind also gut bis sehr gut verträglich.